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Ventajas de la puesta en marcha de cargas de trabajo genómicos en FlexPod

Colaboradores

En esta sección se proporciona una breve lista de ventajas para ejecutar una carga de trabajo genómica en una plataforma de infraestructura convergente FlexPod. Describiremos rápidamente las capacidades de un hospital. La siguiente vista de arquitectura empresarial muestra las capacidades de un hospital puestas en marcha en una plataforma de infraestructura convergente FlexPod preparada para cloud híbrido.

  • * Evitar silos en la salud.* los silos en la salud son una preocupación muy real. A menudo, los departamentos se encuentran organizados en silos en su propio conjunto de hardware y software, no por elección, sino de forma orgánica, por evolución. Por ejemplo, radiología, cardiología, EHR, genómica, análisis, ciclo de ingresos y otros departamentos terminan con su conjunto individual de software y hardware dedicados. Las organizaciones sanitarias mantienen un conjunto limitado de profesionales DE TI para gestionar sus activos de hardware y software. El punto de inflexión se produce cuando se espera que este conjunto de personas gestionen un conjunto de hardware y software muy diversificado. La heterogeneidad se ve agravada por un conjunto incongruente de procesos llevados a la organización sanitaria por los proveedores.

  • Iniciar pequeño y crecer. el kit de herramientas GATK está adaptado para la ejecución de CPU, que mejor paquete de plataformas como FlexPod. FlexPod permite una escalabilidad independiente de la red, el entorno informático y el almacenamiento. Empiece con poco y escale a medida que aumenten sus funcionalidades de genómica y el entorno. Las organizaciones sanitarias no tienen que invertir en plataformas especializadas para ejecutar cargas de trabajo genómicas. En su lugar, las organizaciones pueden aprovechar plataformas versátiles como FlexPod para ejecutar cargas de trabajo genómica y no genómicas en la misma plataforma. Por ejemplo, si el departamento de pediatría quiere implementar una capacidad genómica, los líderes TECNOLÓGICOS pueden aprovisionar computación, almacenamiento y redes en una instancia de FlexPod existente. A medida que crece la unidad de negocio genómica, la organización sanitaria puede escalar su plataforma FlexPod según sea necesario.

  • Un único panel de control y una flexibilidad sin igual. Cisco Intersight simplifica significativamente las operaciones DE TI al unir aplicaciones con la infraestructura, proporcionando visibilidad y gestión desde servidores e hipervisores sin sistema operativo hasta aplicaciones sin servidor, reduciendo así los costes y mitigando el riesgo. Esta plataforma SaaS unificada utiliza un diseño de API abierta unificado que se integra de forma nativa con plataformas y herramientas de terceros. Además, permite la gestión desde su equipo de operaciones de centro de datos in situ o desde cualquier lugar mediante una aplicación móvil.

    Los usuarios liberan rápidamente un valor tangible en su entorno al aprovechar Intersight como su plataforma de gestión. Al permitir la automatización de muchas tareas manuales diarias, Intersight elimina los errores y simplifica las operaciones diarias. Además, las avanzadas capacidades de soporte que ofrece Intersight permiten a los usuarios mantenerse por delante de los problemas y acelerar la resolución de estos. En conjunto, las organizaciones dedican mucho menos tiempo y dinero a la infraestructura de aplicaciones y más tiempo al desarrollo empresarial principal.

    Aprovechar la gestión de Intersight y la arquitectura de FlexPod, fácilmente escalable, permite a las organizaciones ejecutar varias cargas de trabajo de genoma en una única plataforma FlexPod, lo que aumenta el uso y reduce el coste total de propiedad (TCO). FlexPod permite un dimensionamiento flexible, con opciones que empiezan por nuestro pequeño FlexPod Express y se pueden escalar a implementaciones grandes de centros de datos FlexPod. Con las funcionalidades de control de acceso basadas en funciones integradas en Cisco Intersight, las organizaciones sanitarias pueden implementar mecanismos sólidos de control de acceso, lo que evita la necesidad de pilas de infraestructuras independientes. El uso de varias unidades de negocio en la organización sanitaria puede aprovechar la genómica como una competencia principal.

    En última instancia, FlexPod ayuda a simplificar las operaciones DE TI y a reducir los costos operativos y permite que los administradores de infraestructuras DE TI se centren en tareas que ayudan a los médicos a innovar en lugar de quedar relegados a mantener las operaciones básicas.

  • Diseño validado y resultados garantizados. las guías de diseño e implementación de FlexPod se validan para ser repetibles, y cubren detalles completos de la configuración y las mejores prácticas del sector que se necesitan para implementar un FlexPod con confianza. Las guías de diseño validado, las guías de puesta en marcha y las arquitecturas de Cisco y NetApp ayudan a su organización de ciencias biológicas o sanitarias a eliminar las conjeturas de la implantación de una plataforma validada y de confianza desde el principio. Con FlexPod puede acelerar los tiempos de puesta en marcha y reducir costes, complejidad y riesgos. Los diseños validados y las guías de puesta en marcha de FlexPod establecen a FlexPod como la plataforma perfecta para diversas cargas de trabajo de genómica.

  • * Innovación y agilidad.* se recomienda FlexPod como una plataforma ideal por EHR como Epic, Cerner, Meditech y sistemas de imagen como Agfa, GE, Philips. Para obtener más información acerca de "Rollo de honor épico" Y la arquitectura de la plataforma de destino; consulte la web de usuarios de Epic. Ejecutando la genómica "FlexPod" permite a las organizaciones sanitarias continuar su camino de innovación con agilidad. Con FlexPod, la implementación del cambio de organización viene de forma natural. Cuando las organizaciones se estandarizan en una plataforma de FlexPod, los expertos EN TECNOLOGÍA del sector sanitario pueden disponer de tiempo, esfuerzo y recursos para innovar y, por lo tanto, ser tan ágiles como exige el ecosistema.

  • Datos liberados. Con la plataforma de infraestructura convergente FlexPod y el sistema de almacenamiento ONTAP de NetApp, es posible acceder a los datos genómicos utilizando una amplia variedad de protocolos a escala desde una única plataforma. FlexPod con ONTAP de NetApp ofrece una plataforma de cloud híbrido sencilla, intuitiva y potente. Su Data Fabric, impulsado por ONTAP de NetApp, aúna los datos de distintos sitios, sin que los barreras físicas y de todas las aplicaciones. Su Data Fabric se ha creado pensando en empresas basadas en datos en un mundo donde todo gira alrededor de ellos. Los datos se crean y se usan en varias ubicaciones y, a menudo, hay que aprovecharlos y compartirlos con otras ubicaciones, aplicaciones e infraestructuras. Por tanto, se necesita una forma coherente e integrada de gestionarla. FlexPod controla a su equipo DE TECNOLOGÍA y simplifica la cada vez mayor complejidad TECNOLÓGICA.

  • Multitenancy seguro. FlexPod utiliza módulos criptográficos compatibles con FIPS 140-2, lo que permite a las organizaciones implementar la seguridad como un elemento fundamental, no como una idea de última hora. FlexPod permite a las organizaciones implantar multi-tenancy seguro desde una única plataforma de infraestructura convergente, independientemente del tamaño de la plataforma. FlexPod con multi-tenancy seguro y calidad de servicio ayudan con la separación de cargas de trabajo y maximizan la utilización. Esto ayuda a evitar que el capital quede atrapado en plataformas especializadas que potencialmente están infrautilizadas y requiere un conjunto de habilidades especializadas para gestionarlas.

  • La eficiencia del almacenamiento. la genómica requiere que el almacenamiento subyacente tenga las funcionalidades de eficiencia del almacenamiento líderes en el sector. Puede reducir los costes de almacenamiento con funciones de eficiencia del almacenamiento de NetApp como la deduplicación (inline y bajo demanda), la compresión de datos y la compactación de datos ( "ref"). La deduplicación de NetApp proporciona deduplicación a nivel de bloque en un volumen FlexVol. En esencia, la deduplicación elimina los bloques duplicados y solo almacena los bloques únicos en el volumen FlexVol. La deduplicación funciona con un alto grado de granularidad y funciona en el sistema de archivos activo del volumen FlexVol. En la siguiente figura se muestra información general sobre el funcionamiento de la deduplicación de NetApp. La deduplicación es transparente para las aplicaciones. Por lo tanto, se puede usar para deduplicar datos originados por cualquier aplicación que utilice el sistema de NetApp. Puede ejecutar la deduplicación del volumen como un proceso en línea y como un proceso en segundo plano. Es posible configurarlo para que se ejecute automáticamente, para que se programe o manualmente a través de la CLI, ONTAP System Manager de NetApp o Active IQ Unified Manager de NetApp.

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  • Permitir la interoperabilidad genómica. ONTAP FlexCache es una capacidad de almacenamiento en caché remoto que simplifica la distribución de archivos, reduce la latencia WAN y reduce los costes de ancho de banda WAN ( "ref"). Una de las actividades clave durante la identificación y anotación de variantes genómicas es la colaboración entre los médicos. La tecnología ONTAP FlexCache aumenta el rendimiento de los datos incluso cuando los médicos colaboradores se encuentran en diferentes ubicaciones geográficas. Dado el tamaño típico de un archivo *.BAM (de 1 GB a 100 s de GB), es fundamental que la plataforma subyacente pueda hacer que los archivos estén disponibles para los médicos en diferentes ubicaciones geográficas. FlexPod con ONTAP FlexCache hace que los datos genómicos y las aplicaciones estén realmente listos para los distintos sitios, lo que convierte la colaboración entre investigadores de todo el mundo en un proceso fluido con una baja latencia y un alto rendimiento. Las organizaciones sanitarias que ejecutan aplicaciones de genómica en un entorno multisitio pueden escalarse horizontalmente usando la estructura de datos para equilibrar la capacidad de gestión con el coste y la velocidad.

  • Uso inteligente de la plataforma de almacenamiento. FlexPod con la clasificación automática por niveles de ONTAP y la tecnología Fabric Pool de NetApp simplifica la gestión de datos. FabricPool ayuda a reducir los costes de almacenamiento sin comprometer el rendimiento, la eficiencia, la seguridad o la protección. FabricPool es transparente para las aplicaciones empresariales y aprovecha las eficiencias del cloud al reducir el TCO del almacenamiento sin necesidad de rediseñar la arquitectura de la infraestructura de aplicaciones. FlexPod se puede beneficiar de las funcionalidades de almacenamiento por niveles de FabricPool para hacer un uso más eficiente del almacenamiento flash de ONTAP. Para obtener más información, consulte "FlexPod con FabricPool". El siguiente diagrama proporciona una descripción general de alto nivel de FabricPool y sus ventajas.

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  • Análisis y anotación de variantes más rápidos. la plataforma FlexPod es más rápida de implementar y operar. La plataforma FlexPod permite la colaboración entre los médicos, al poner los datos a escala con baja latencia y un mayor rendimiento. Una mayor interoperabilidad permite innovar. Las organizaciones sanitarias pueden ejecutar sus cargas de trabajo genómicos y no genómicas en paralelo, lo que significa que las organizaciones no necesitan plataformas especializadas para iniciar la transición a la genómica.

    FlexPod ONTAP añade habitualmente funciones innovadoras a la plataforma de almacenamiento. Centro de datos FlexPod es la base de infraestructura compartida óptima para poner en marcha FC- NVMe para permitir acceso al almacenamiento de alto rendimiento a aplicaciones que lo necesiten. A medida que FC- NVMe evoluciona para incluir alta disponibilidad, multivía y compatibilidad con sistemas operativos adicionales, FlexPod se adapta perfectamente a la plataforma preferida, lo que proporciona la escalabilidad y fiabilidad necesarias para respaldar estas funcionalidades. ONTAP con una I/o más rápida con NVMe integral permite que los análisis de genomas se completen con mayor rapidez ( "ref").

    Los datos del genoma en secuencia RAW producen tamaños de archivo grandes, y es importante que estos archivos estén disponibles para los analizadores de variantes para reducir el tiempo total que toma de la colección de muestras a la anotación de variante. NVMe (memoria no volátil rápida) cuando se utiliza como protocolo de acceso al almacenamiento y transporte de datos proporciona niveles de rendimiento sin precedentes y los tiempos de respuesta más rápidos. FlexPod pone en marcha el protocolo NVMe a la vez que accede al almacenamiento flash a través del bus PCI Express (PCIe). PCIe posibilita la implementación de decenas de miles de colas de comandos, lo que aumenta la paralelización y el rendimiento. Un único protocolo del almacenamiento a la memoria acelera el acceso a los datos.

  • Agilidad para la investigación clínica desde el principio. capacidad de almacenamiento flexible y ampliable y rendimiento permite a las organizaciones de investigación sanitaria optimizar el medio ambiente de una manera elástica o puntual (JIT). Al desacoplar el almacenamiento de la infraestructura informática y de red, la plataforma FlexPod se puede escalar horizontal y verticalmente sin interrupciones. Con Cisco Intersight, la plataforma FlexPod se puede gestionar con flujos de trabajo automatizados integrados y personalizados. Los flujos de trabajo de Cisco Intersight permiten a las organizaciones sanitarias reducir los tiempos de gestión del ciclo de vida de las aplicaciones. Cuando un centro médico académico exige que los datos de los pacientes se anonimien y pongan a disposición de su centro de investigación informática y/o centro de calidad, su organización DE TI puede aprovechar los flujos de trabajo de Cisco Intersight FlexPod para realizar backups, clonarlos y restaurarlos con seguridad en cuestión de segundos y no de horas. Con Trident y Kubernetes de NetApp, las organizaciones TECNOLÓGICAS pueden suministrar nuevos científicos de datos y hacer que los datos clínicos estén disponibles para el desarrollo de modelos en cuestión de minutos, y en ocasiones incluso en segundos.

  • La protección de datos genómicos. SnapLock de NetApp proporciona un volumen para una finalidad especial en el que los ficheros se pueden almacenar y realizar transacciones a un estado que no puede borrarse ni escribirse. Los datos de producción del usuario que se encuentran en un volumen FlexVol se pueden duplicar o realizar copias vault en un volumen SnapLock mediante la tecnología SnapMirror o SnapVault de NetApp. Los archivos del volumen de SnapLock, el volumen en sí y su agregado de alojamiento no se pueden eliminar hasta que finalice el período de retención. Mediante el software FPolicy de ONTAP, las organizaciones pueden evitar ataques de ransomware al dejar las operaciones en archivos con extensiones específicas. Es posible activar un evento de FPolicy para operaciones de archivos específicas. El evento está ligado a una política, que llama al motor que necesita utilizar. Puede configurar una política con un conjunto de extensiones de archivo que potencialmente puedan contener ransomware. Cuando un archivo con una extensión no permitida intenta realizar una operación no autorizada, FPolicy impide que esa operación se ejecute ("ref").

  • Soporte conjunto de FlexPod. NetApp y Cisco han establecido el soporte conjunto de FlexPod, un modelo de soporte sólido, escalable y flexible para cumplir los requisitos de soporte exclusivos de la infraestructura convergente de FlexPod. Este modelo aprovecha la experiencia combinada, recursos y conocimientos de soporte técnico de NetApp y Cisco para ofrecer un proceso optimizado para identificar y solucionar problemas de soporte de FlexPod, independientemente de dónde se encuentre el problema. En la siguiente figura, se ofrece una descripción general del modelo de soporte conjunto de FlexPod. El cliente se pone en contacto con el proveedor que podría ser el propietario del problema y tanto Cisco como NetApp trabajan conjuntamente para resolverlo. Cisco y NetApp cuentan con equipos de desarrollo e ingeniería de múltiples empresas que trabajan conjuntamente para solucionar problemas. Este modelo de soporte reduce la pérdida de información durante la traducción, permite la confianza y reduce el tiempo de inactividad.

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