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FlexPod
본 한국어 번역은 사용자 편의를 위해 제공되는 기계 번역입니다. 영어 버전과 한국어 버전이 서로 어긋나는 경우에는 언제나 영어 버전이 우선합니다.

TR-4911: FlexPod 유전체학

기여자

NetApp, JayaKishore Esanakula

의료 및 생명 과학에 유전체학보다 더 중요한 의학 분야는 거의 없으며 유전체학은 의사와 간호사를 위한 핵심 임상 도구로 빠르게 부상하고 있습니다. 유전체학을 의료 영상 및 디지털 병리학과 결합하면 환자의 유전자가 치료 프로토콜의 영향을 받을 수 있는 방법을 이해하는 데 도움이 됩니다. 의료 분야에서 유전체학이 성공하려면 규모에 따른 데이터 상호 운용성이 크게 중요합니다. 최종 목표는 방대한 양의 유전자 데이터를 파악하고 임상적으로 관련된 상관 관계 및 변이를 파악하여 진단을 개선하고 정밀 약물을 현실화시키는 것입니다. 유전체학은 질병 발병의 근원, 질병의 발전 방식, 효과적인 치료법 및 전략을 이해하는 데 도움이 됩니다. 유전체학은 예방, 진단 및 치료를 포괄하는 많은 이점을 지니고 있습니다. 의료 조직에서는 다음과 같은 여러 당면 과제를 해결하기 위해 노력하고 있습니다.

  • 진료 품질 개선

  • 가치 기반 케어

  • 데이터 급증

  • 정밀 의학

  • 펜데믹

  • 웨어러블, 원격 모니터링 및 관리

  • 사이버 보안

표준화된 임상 경로 및 임상 프로토콜은 현대 의학의 중요한 구성 요소 중 하나입니다. 표준화의 주요 측면 중 하나는 의료 기록 뿐만 아니라 게놈 데이터에도 의료 서비스 공급자 간의 상호 운용성입니다. 가장 큰 질문은 의료 조직에서 개인 유전체학 데이터 및 관련 의료 기록에 대한 환자 소유권을 대신 유전자 데이터에 대한 소유권을 양도합니까?

상호 운용이 가능한 환자 데이터는 최근 폭발적인 데이터 증가에 따른 원동력인 정밀 의학의 핵심 요소입니다. 정밀 의학의 목적은 건강 관리, 질병 예방, 진단 및 치료 솔루션을 보다 효과적이고 정확하게 만드는 것입니다.

데이터 증가율은 기하급수적으로 상승했습니다. 2021년 2월 초에 미국 실험실은 주당 약 8,000개의 COVID-19 균주를 염기서열했습니다. 염기서열화된 게놈은 2021년 4월까지 주당 29,000개로 증가했습니다. 완전한 염기서열을 갖춘 각 인간 게놈의 크기는 약 125GB입니다. 따라서 주당 2만 9천 게놈을 염기서열화하는 속도로 휴지 중인 전체 게놈 스토리지는 연간 180페타바이트 이상이 될 것입니다. 여러 국가에서 게놈 감시를 개선하고 세계 보건 문제의 다음 물결에 대비하기 위해 게놈 역학을 위한 리소스를 제공하고 있습니다.

게놈 연구 비용의 감소는 유례없는 속도로 유전자 검사 및 연구를 주도하고 있습니다. 세 가지 PS는 컴퓨터 성능, 데이터의 개인 정보 보호 및 의료 개인화의 변곡점에 있습니다. 2025년까지 연구자들은 1억~20억 개의 인간 게놈을 염기서열화될 것으로 추정하고 있습니다. 유전체학이 효과적이고 가치 있는 제안을 하려면 유전체학 기능이 진료 워크플로우의 원활한 일부여야 합니다. 유전체학은 환자 방문 시 쉽게 액세스하고 조치를 취할 수 있어야 합니다. 환자 전자 의료 기록 데이터를 환자 게놈 데이터와 통합하는 것도 마찬가지로 중요합니다. FlexPod와 같은 최첨단 통합 인프라가 등장하면서 기업은 의사, 간호사 및 클리닉 관리자의 일상 업무 흐름에 유전체학 기능을 활용할 수 있습니다. 최신 FlexPod 플랫폼에 대한 자세한 내용은 다음을 참조하십시오 "Cisco UCS X-Series 지원 FlexPod 데이터 센터 백서".

의사의 경우 유전체학의 진정한 가치는 정밀 의학 및 환자의 게놈 데이터를 기반으로 한 맞춤형 치료 계획을 포함합니다. 과거에 임상의와 데이터 과학자 간에 상당한 시너지 효과를 경험한 적이 없으며, 유전체학은 최근 기술 혁신을 통해 이점을 얻고 있으며, 의료 조직과 업계 기술 리더 간의 진정한 협력 관계를 통해 이점을 얻고 있습니다.

학술 의료 센터와 기타 의료 및 생명 과학 조직은 게놈 과학 분야의 우수 센터(COE)를 설립하는 데 주력하고 있습니다. 닥터 Charlie Gersbach, 박사 그렉 크로포드와 닥터 Duke University의 Tim E Reddy는 다음과 같이 말합니다. "우리는 유전자가 단순한 바이너리 스위치로 켜지거나 꺼지는 것이 아니라 여러 개의 유전자 규제 스위치가 함께 작동한다는 것을 알고 있습니다. 또한 "게놈의 이 부분 중 어느 것도 단독으로 효과가 없다는 것을 확인했습니다. 게놈은 매우 복잡한 웹으로, 진화가 발전해 왔습니다.”( "참조")를 클릭합니다.

NetApp과 Cisco는 10년 이상 FlexPod 플랫폼의 증분적 개선을 구현하기 위해 노력하고 있습니다. 모든 고객 피드백은 FlexPod의 가치 스트림 및 기능 세트와 함께 듣고 평가하며 연결됩니다. FlexPod를 전 세계적으로 신뢰할 수 있는 통합 인프라 플랫폼으로 차별화하는 피드백, 협업, 개선 및 축하의 연속적 루프입니다. 이 플랫폼은 처음부터 의료 조직을 위한 가장 안정적이고 강력하며 다재다능하고 민첩한 플랫폼으로 간소화되고 설계되었습니다.

범위

FlexPod 통합 인프라 플랫폼을 사용하는 의료 조직은 하나 이상의 게놈 워크로드를 다른 임상 및 비임상 의료 애플리케이션과 함께 호스팅할 수 있습니다. 이 기술 보고서에서는 FlexPod 플랫폼 검증 중에 GATK라는 업계 표준 오픈 소스 게놈 도구를 사용합니다. 그러나 유전체학 또는 GATK에 대한 보다 자세한 설명은 이 문서의 범위를 벗어납니다.

대상

이 문서는 의료 산업의 기술 리더 및 Cisco와 NetApp 파트너 솔루션 엔지니어 및 프로페셔널 서비스 직원을 위한 것입니다. NetApp은 사용자가 컴퓨팅 및 스토리지 사이징 개념을 잘 이해하고 있을 뿐만 아니라 의료 위협, 의료 보안, 의료 IT 시스템, Cisco UCS 및 NetApp 스토리지 시스템에 대한 기술적 지식을 갖추고 있다고 가정합니다.

FlexPod에 구축된 병원 기능

일반적인 한 병원은 IT 시스템을 다각화했습니다. 이러한 시스템의 대부분은 공급업체에서 구입한 반면 병원 시스템에 의해 구축된 시스템은 거의 없습니다. 따라서 병원 시스템은 데이터 센터의 다양한 인프라 환경을 관리해야 합니다. 병원이 시스템을 FlexPod와 같은 통합 인프라 플랫폼으로 통합할 경우, 조직은 데이터 센터 운영을 표준화할 수 있습니다. FlexPod를 통해 의료 조직은 임상 및 비임상 시스템을 동일한 플랫폼에 구현하여 데이터 센터의 운영을 통합할 수 있습니다.

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