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La version française est une traduction automatique. La version anglaise prévaut sur la française en cas de divergence.

Avantages liés au déploiement de workloads génomiques avec FlexPod

Contributeurs

Dans cette section, vous trouverez un bref aperçu des avantages dont vous pouvez bénéficier pour exécuter un workload génomique sur une plateforme d'infrastructure convergée FlexPod. Décrire rapidement les capacités d'un hôpital. L'architecture métier suivante montre les capacités d'un hôpital déployées sur une plateforme d'infrastructure convergée FlexPod prête pour le cloud hybride.

  • Éviter les silos dans les soins de santé. les silos dans les soins de santé sont une préoccupation très réelle. Elles sont souvent cloisonnées dans leur propre ensemble de matériel et de logiciels, et non pas selon leur choix, mais de façon organique par leur évolution. Par exemple, radiologie, cardiologie, EHR, génomique, les analyses, les cycles de revenus et les autres départements se terminent par leur jeu individuel de logiciels et de matériel dédiés. Les organismes de santé disposent d'un ensemble limité de professionnels IT pour gérer leurs ressources matérielles et logicielles. Le point d'inflexion s'est produit lorsque ce groupe de particuliers doit gérer un ensemble très diversifié de matériel et de logiciels. L'hétérogénéité est aggravée par un ensemble peu homogène de processus mis en place par les fournisseurs dans l'organisation de soins de santé.

  • Démarrer petit et grandir. le kit d'outils GATK est réglé pour l'exécution de la CPU, qui les meilleures suites plates-formes comme FlexPod. FlexPod offre une évolutivité indépendante du réseau, du calcul et du stockage. Commencez par une infrastructure de petite taille et faites-la évoluer à mesure que vos capacités en génomique et votre environnement se développent. Les organismes de santé n’ont pas à investir dans des plateformes spécialisées pour gérer des charges de travail génomiques. Les entreprises peuvent ainsi exploiter des plateformes polyvalentes telles qu'un système FlexPod pour exécuter des charges de travail génomiques et non génomiques sur une même plateforme. Par exemple, si le service de pédiatrie souhaite mettre en œuvre une fonctionnalité de génomique, le leadership INFORMATIQUE peut provisionner les ressources de calcul, de stockage et de réseau sur une instance FlexPod existante. À mesure que l'entité commerciale génomique se développe, le secteur de la santé peut faire évoluer sa plateforme FlexPod en fonction des besoins.

  • Panneau de contrôle unique et flexibilité inégalée. Cisco Intersight simplifie considérablement les opérations INFORMATIQUES en rapprochant les applications de l'infrastructure, en fournissant la visibilité et la gestion des serveurs bare-Metal et des hyperviseurs aux applications sans serveur, réduisant ainsi les coûts et les risques. Cette plateforme SaaS unifiée s'intègre de façon native aux plateformes et outils tiers. Elle permet en outre de gérer l'ensemble des opérations de votre data Center sur site ou en tout lieu, à l'aide d'une application mobile.

    Les utilisateurs valorisent rapidement leur environnement en utilisant Intersight comme plateforme de gestion. En permettant l'automatisation de nombreuses tâches manuelles quotidiennes, InterSight élimine les erreurs et simplifie vos opérations quotidiennes. En outre, les capacités de support avancées offertes par Intersight permettent aux utilisateurs de garder une longueur d'avance et d'accélérer la résolution des problèmes. Combinées, les entreprises réduisent considérablement leur infrastructure applicative et consacrent plus de temps au développement de leur activité principale.

    En tirant parti de la gestion Intersight et de l'architecture facilement évolutive de FlexPod, les entreprises peuvent exécuter plusieurs charges de travail du génome sur une plateforme FlexPod unique, ce qui améliore le taux d'utilisation et réduit le coût total de possession (TCO). FlexPod offre des possibilités de dimensionnement flexibles, avec des choix parmi notre petite infrastructure FlexPod Express et une évolutivité vers de grandes implémentations FlexPod Datacenter. Grâce aux fonctionnalités de contrôle d'accès basées sur des rôles intégrées dans Cisco InterSight, les établissements de santé peuvent mettre en place des mécanismes de contrôle d'accès robustes, ce qui évite d'avoir recours à des piles d'infrastructure distinctes. Plusieurs entités commerciales peuvent exploiter la génomique comme une compétence clé dans le domaine de la santé.

    En définitive, FlexPod simplifie les opérations IT et réduit les coûts d'exploitation, et permet aux administrateurs D'infrastructure IT de se concentrer sur des tâches permettant aux médecins d'innover au lieu de rester relégués au second plan.

  • Conception validée et résultats garantis. les guides de conception et de déploiement FlexPod sont validés de manière reproductible et couvrent les détails complets de la configuration et les meilleures pratiques du secteur nécessaires au déploiement en toute confiance d'un FlexPod. Les guides de conception validée par Cisco et NetApp, les guides de déploiement et les architectures aident votre département des soins de santé ou des sciences de la vie à éviter toute approximation lors de la mise en œuvre d'une plateforme validée et fiable dès le départ. Avec FlexPod, vous accélérez les délais de déploiement, tout en réduisant les coûts, la complexité et les risques. Les designs validés et les guides de déploiement de FlexPod établissent le FlexPod comme plateforme idéale pour de nombreuses charges de travail génomiques.

  • Innovation et agilité. FlexPod est recommandé comme plate-forme idéale par les EHR comme Epic, Cerner, Meditech et les systèmes d'imagerie comme Agfa, GE, Philips. Pour plus d'informations sur "Le programme « Epic Honor roll »" Et l'architecture de la plateforme cible, consultez le site Web d'Epic userweb. Une bonne exécution de la génomique "FlexPod" permet aux établissements de santé de poursuivre leur transition vers l'innovation avec agilité. Avec FlexPod, la mise en œuvre de changements organisationnels est naturelle. Lorsque les entreprises optent pour une plateforme FlexPod, les experts du secteur de la santé peuvent provisionner leur temps, leurs efforts et leurs ressources pour innover, et ainsi être aussi agiles que les besoins de l'écosystème.

  • Données libérées. avec la plateforme d'infrastructure convergée FlexPod et un système de stockage NetApp ONTAP, les données génomiques peuvent être disponibles et accessibles à l'aide d'un large éventail de protocoles à grande échelle depuis une plateforme unique. FlexPod avec NetApp ONTAP propose une plateforme de cloud hybride simple, intuitive et puissante. Votre Data Fabric optimisé par NetApp ONTAP offre un maillage sur l'ensemble des sites, des emplacements physiques et des applications, Votre Data Fabric est conçue pour un monde centré sur la donnée. Les données étant créées et exploitées dans divers emplacements et, la plupart du temps, partagées avec d'autres sites, applications et infrastructures, C'est pourquoi il vous faut une méthode de gestion cohérente et intégrée. FlexPod permet à votre équipe IT de maîtriser et de simplifier une INFRASTRUCTURE IT toujours plus complexe.

  • Colocation sécurisée. FlexPod utilise des modules cryptographiques conformes à la norme FIPS 140-2, ce qui permet aux entreprises de mettre en œuvre la sécurité comme élément fondamental, et non comme élément secondaire. FlexPod permet aux entreprises d'implémenter une colocation sécurisée à partir d'une plateforme d'infrastructure convergée unique, quelle que soit leur taille. FlexPod avec colocation sécurisée et qualité de service pour séparer les charges de travail et optimiser l'utilisation. Cela permet d'éviter que le capital soit dépendant de plateformes spécialisées sous-utilisées et que la gestion requiert une compétence spécialisée.

  • Efficacité du stockage. la génomique exige que le stockage sous-jacent offre des fonctionnalités d'efficacité du stockage de pointe. Vous pouvez réduire les coûts du stockage grâce aux fonctionnalités d'efficacité du stockage NetApp, telles que la déduplication (à la volée et à la demande), la compression et la compaction des données ( "réf"). La déduplication NetApp fournit une déduplication au niveau des blocs dans un volume FlexVol. Pour schématiser, la déduplication supprime les blocs dupliqués et ne stocke que les blocs uniques dans le volume FlexVol. La déduplication, qui fonctionne avec un niveau de granularité élevé, fonctionne sur le système de fichiers actif du volume FlexVol. La figure suivante présente le fonctionnement de la déduplication NetApp. La déduplication est transparente pour les applications. Par conséquent, elle peut être utilisée pour dédupliquer des données provenant de toute application qui utilise le système NetApp. Vous pouvez exécuter la déduplication volume comme processus à la volée ou en arrière-plan. Vous pouvez le configurer pour qu'il s'exécute automatiquement, de manière à être planifié ou manuellement via l'interface de ligne de commande, NetApp ONTAP System Manager ou NetApp Active IQ Unified Manager.

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  • Activer l'interopérabilité génomique. ONTAP FlexCache est une fonctionnalité de mise en cache à distance qui simplifie la distribution de fichiers, réduit la latence WAN et réduit les coûts de bande passante WAN ( "réf"). L'une des principales activités durant l'identification et l'annotation des variantes génomiques est la collaboration entre les cliniciens. La technologie ONTAP FlexCache augmente le débit de données même lorsque les médecins travaillent en collaboration à différents endroits. Étant donné la taille type d'un fichier *.BAM (1 Go à des centaines de Go), il est essentiel que la plate-forme sous-jacente puisse mettre des fichiers à la disposition des cliniciens dans différents emplacements géographiques. Avec FlexPod et ONTAP FlexCache, les données et les applications génomiques sont réellement prêtes pour plusieurs sites afin que la collaboration entre les chercheurs du monde entier s'effectue de manière fluide, avec une faible latence et un débit élevé. Les organismes de santé qui exécutent des applications génomiques dans un environnement multisite peuvent évoluer horizontalement avec la Data Fabric pour équilibrer la gestion avec la vitesse et les coûts.

  • Utilisation intelligente de la plateforme de stockage. FlexPod avec hiérarchisation automatique ONTAP et technologie NetApp Fabric Pool simplifie la gestion des données. FabricPool permet de réduire les coûts de stockage sans nuire aux performances, à l'efficacité, à la sécurité ou à la protection. FabricPool est transparent pour les applications d'entreprise et capitalise sur l'efficacité du cloud en réduisant le TCO du stockage sans devoir repenser l'architecture de l'infrastructure applicative. FlexPod bénéficie des fonctionnalités de hiérarchisation du stockage de FabricPool pour une utilisation plus efficace du stockage Flash ONTAP. Pour plus d'informations, voir "FlexPod avec FabricPool". Le diagramme suivant présente FabricPool et ses avantages.

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  • Analyse et annotation des variantes plus rapides. la plate-forme FlexPod est plus rapide à déployer et opérationnaliser. Avec la plateforme FlexPod, les médecins peuvent collaborer avec les médecins en rendant les données à grande échelle, avec une faible latence et un débit plus élevé. L'interopérabilité accrue favorise l'innovation. Les établissements de santé peuvent traiter leurs workloads génomiques et non génomiques, ce qui signifie qu'elles n'ont pas besoin de plateformes spécialisées pour commencer leur transition vers la génomique.

    FlexPod ONTAP ajoute régulièrement des fonctionnalités de pointe à la plateforme de stockage. FlexPod Datacenter constitue une base d'infrastructure partagée idéale pour déployer la technologie FC- NVMe afin d'autoriser l'accès au stockage haute performance aux applications en besoin. Au fur et à mesure que la connectivité FC- NVMe évolue, incluant la haute disponibilité, les chemins d'accès multiples et une prise en charge supplémentaire du système d'exploitation, FlexPod convient aussi bien à la plateforme de choix, offrant l'évolutivité et la fiabilité nécessaires pour prendre en charge ces fonctionnalités. Grâce à la technologie ONTAP dotée d'E/S plus rapides et à la technologie NVMe de bout en bout, les analyses génomiques sont plus rapides ( "réf").

    Les données de génome brut séquencé génèrent des fichiers de grandes tailles et il est important que ces fichiers soient mis à la disposition des analyseurs variantes pour réduire le temps total nécessaire de la collecte des échantillons à l'annotation des variantes. NVMe (Nonvolatile Memory Express), utilisé comme protocole d'accès au stockage et de transport de données, offre un débit sans précédent et des délais de réponse très courts. FlexPod déploie le protocole NVMe en accédant au stockage Flash via le bus PCI express (PCIe). Grâce à l'implémentation de dizaines de milliers de files d'attente de commandes, il est possible d'augmenter la parallélisation et le débit. Un protocole unique, du stockage à la mémoire, permet un accès rapide aux données.

  • * L'agilité pour la recherche clinique depuis le départ.* la capacité de stockage flexible et extensible et la performance permet aux organismes de recherche en santé d'optimiser l'environnement de façon élastique ou juste-à-temps (JIT). En découplant le stockage de l'infrastructure de calcul et de réseau, la plateforme FlexPod peut évoluer verticalement et horizontalement sans perturbation. Grâce à Cisco Intersight, la plateforme FlexPod peut être gérée à l'aide de flux de travail automatisés intégrés et personnalisés. Les workflows Cisco Intersight permettent aux établissements de santé de réduire la durée de gestion du cycle de vie des applications. Lorsqu'un centre médical universitaire exige que les données des patients soient anonymisées et mises à disposition par son centre d'informatique pour la recherche et/ou d'un centre de qualité, le service IT peut exploiter les workflows Cisco Intersight FlexPod pour effectuer des sauvegardes de données sécurisées, cloner et restaurer les données en quelques secondes, et non plus en quelques heures. Avec NetApp Trident et Kubernetes, les départements IT peuvent provisionner de nouveaux data Scientists et rendre les données cliniques disponibles pour le développement des modèles en quelques minutes, parfois même en quelques secondes.

  • Protection des données du génome. NetApp SnapLock offre un volume spécial dans lequel les fichiers peuvent être stockés et archivés à un état non effaçable et non réinscriptible. Les données de production de l'utilisateur résidant dans un volume FlexVol peuvent être mises en miroir ou archivées sur un volume SnapLock grâce à la technologie NetApp SnapMirror ou SnapVault. Les fichiers du volume SnapLock, le volume lui-même et son agrégat d'hébergement ne peuvent pas être supprimés avant la fin de la période de conservation. Grâce au logiciel ONTAP FPolicy, les organisations peuvent empêcher les attaques par ransomware en désautorisant les opérations sur des fichiers avec des extensions spécifiques. Un événement FPolicy peut être déclenché pour des opérations de fichiers spécifiques. L'événement est lié à une politique, qui appelle le moteur qu'il doit utiliser. Vous pouvez configurer une règle avec un ensemble d'extensions de fichiers qui pourraient éventuellement contenir un ransomware. Lorsqu'un fichier doté d'une extension non autorisée tente d'effectuer une opération non autorisée, FPolicy empêche cette opération ("réf").

  • Support coopératif FlexPod. NetApp et Cisco ont mis en place le modèle de support coopératif FlexPod, un modèle de support solide, évolutif et flexible, afin de répondre aux exigences de support uniques de l'infrastructure convergée FlexPod. Ce modèle tire parti de l'expérience, des ressources et de l'expertise de NetApp et de Cisco pour simplifier l'identification et la résolution des problèmes de support FlexPod, et ce, quelle que soit l'origine du problème. La figure suivante présente le modèle de support coopératif FlexPod. Le client contacte le fournisseur responsable du problème et travaille en collaboration avec Cisco et NetApp pour le résoudre. Cisco et NetApp ont des équipes d'ingénierie et de développement interentreprises qui travaillent main dans la main pour résoudre les problèmes. Ce modèle de support réduit la perte d'informations pendant la traduction, favorise la confiance et réduit les temps d'arrêt.

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