Dualidade de dados para cientistas de dados e outras aplicações
Os dados estão disponíveis em NFS e acessados em S3 pelo AWS SageMaker.
Requisitos de tecnologia
Você precisa dos notebooks NetApp BlueXP , NetApp Cloud Volumes ONTAP e AWS SageMaker para o caso de uso de dualidade de dados.
Requisitos de software
A tabela a seguir lista os componentes de software necessários para implementar o caso de uso.
Software | Quantidade |
---|---|
BlueXP |
1 |
NetApp Cloud Volumes ONTAP |
1 |
Caderno do AWS SageMaker |
1 |
Procedimentos de implantação
A implantação da solução de dualidade de dados envolve as seguintes tarefas:
-
Conetor BlueXP
-
NetApp Cloud Volumes ONTAP
-
Dados para aprendizado de máquina
-
AWS SageMaker
-
Aprendizado de máquina validado com os notebooks Jupyter
Conetor BlueXP
Nesta validação, usamos a AWS. Também é aplicável ao Azure e ao Google Cloud. Para criar um BlueXP Connector na AWS, execute as seguintes etapas:
-
Usamos as credenciais com base na assinatura mcarl-mercado no BlueXP .
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Escolha a região adequada ao seu ambiente (por exemplo, US-East-1 [N. Virginia]) e selecione o método de autenticação (por exemplo, assumir função ou chaves AWS). Nesta validação, usamos as chaves da AWS.
-
Forneça o nome do conetor e crie uma função.
-
Forneça os detalhes da rede, como a VPC, a sub-rede ou o par de chaves, dependendo se você precisa ou não de um IP público.
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Forneça os detalhes para o grupo de segurança, como acesso HTTP, HTTPS ou SSH a partir do tipo de origem, como informações de qualquer lugar e intervalo IP.
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Reveja e crie o conetor BlueXP .
-
Verifique se o estado da instância do BlueXP EC2 está em execução no console da AWS e verifique o endereço IP na guia rede.
-
Inicie sessão na interface do utilizador do conetor a partir do portal BlueXP ou pode utilizar o endereço IP para aceder a partir do browser.
NetApp Cloud Volumes ONTAP
Para criar uma instância do Cloud Volumes ONTAP no BlueXP , execute as seguintes etapas:
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Crie um novo ambiente de trabalho, selecione o provedor de nuvem e selecione o tipo de instância do Cloud Volumes ONTAP (como CVO único, HA ou Amazon FSX ONTAP for ONTAP).
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Forneça detalhes como o nome e as credenciais do cluster do Cloud Volumes ONTAP. Nesta validação, criamos uma instância do Cloud Volumes ONTAP chamada
svm_sagemaker_cvo_sn1
. -
Selecione os serviços necessários para o Cloud Volumes ONTAP. Nesta validação, optamos por monitorar apenas, então desativamos Data Sense & Compliance e Backup to Cloud Services.
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Na seção localização e conetividade, selecione a região da AWS, VPC, sub-rede, grupo de segurança, método de autenticação SSH e uma senha ou um par de chaves.
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Escolha o método de carregamento. Usamos Professional para essa validação.
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Você pode escolher um pacote pré-configurado, como POC e pequenas cargas de trabalho, cargas de trabalho de produção de dados de bancos de dados e aplicativos, DR econômico ou cargas de trabalho de produção de maior desempenho. Nesta validação, escolhemos POC e pequenas cargas de trabalho.
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Crie um volume com um tamanho específico, protocolos permitidos e opções de exportação. Nesta validação, criamos um volume chamado
vol1
. -
Escolha um tipo de disco de perfil e uma política de disposição em camadas. Nesta validação, desativamos eficiência de armazenamento e SSD de uso geral – desempenho dinâmico.
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Finalmente, revise e crie a instância do Cloud Volumes ONTAP. Em seguida, aguarde 15-20 minutos para que o BlueXP crie o ambiente de trabalho do Cloud Volumes ONTAP.
-
Configure os seguintes parâmetros para ativar o protocolo Duality. O protocolo Duality (NFS/S3) é suportado pelo ONTAP 9. 12,1 e mais tarde.
-
Nessa validação, criamos um SVM chamado
svm_sagemaker_cvo_sn1
e volumevol1
. -
Verifique se o SVM tem suporte a protocolos NFS e S3. Caso contrário, modifique o SVM para apoiá-lo.
sagemaker_cvo_sn1::> vserver show -vserver svm_sagemaker_cvo_sn1 Vserver: svm_sagemaker_cvo_sn1 Vserver Type: data Vserver Subtype: default Vserver UUID: 911065dd-a8bc-11ed-bc24-e1c0f00ad86b Root Volume: svm_sagemaker_cvo_sn1_root Aggregate: aggr1 NIS Domain: - Root Volume Security Style: unix LDAP Client: - Default Volume Language Code: C.UTF-8 Snapshot Policy: default Data Services: data-cifs, data-flexcache, data-iscsi, data-nfs, data-nvme-tcp Comment: Quota Policy: default List of Aggregates Assigned: aggr1 Limit on Maximum Number of Volumes allowed: unlimited Vserver Admin State: running Vserver Operational State: running Vserver Operational State Stopped Reason: - Allowed Protocols: nfs, cifs, fcp, iscsi, ndmp, s3 Disallowed Protocols: nvme Is Vserver with Infinite Volume: false QoS Policy Group: - Caching Policy Name: - Config Lock: false IPspace Name: Default Foreground Process: - Logical Space Reporting: true Logical Space Enforcement: false Default Anti_ransomware State of the Vserver's Volumes: disabled Enable Analytics on New Volumes: false Enable Activity Tracking on New Volumes: false sagemaker_cvo_sn1::>
-
-
Crie e instale um certificado de CA, se necessário.
-
Crie uma política de dados de serviço.
sagemaker_cvo_sn1::*> network interface service-policy create -vserver svm_sagemaker_cvo_sn1 -policy sagemaker_s3_nfs_policy -services data-core,data-s3-server,data-nfs,data-flexcache sagemaker_cvo_sn1::*> network interface create -vserver svm_sagemaker_cvo_sn1 -lif svm_sagemaker_cvo_sn1_s3_lif -service-policy sagemaker_s3_nfs_policy -home-node sagemaker_cvo_sn1-01 -address 172.30.10.41 -netmask 255.255.255.192 Warning: The configured failover-group has no valid failover targets for the LIF's failover-policy. To view the failover targets for a LIF, use the "network interface show -failover" command. sagemaker_cvo_sn1::*> sagemaker_cvo_sn1::*> network interface show Logical Status Network Current Current Is Vserver Interface Admin/Oper Address/Mask Node Port Home ----------- ---------- ---------- ------------------ ------------- ------- ---- sagemaker_cvo_sn1 cluster-mgmt up/up 172.30.10.40/26 sagemaker_cvo_sn1-01 e0a true intercluster up/up 172.30.10.48/26 sagemaker_cvo_sn1-01 e0a true sagemaker_cvo_sn1-01_mgmt1 up/up 172.30.10.58/26 sagemaker_cvo_sn1-01 e0a true svm_sagemaker_cvo_sn1 svm_sagemaker_cvo_sn1_data_lif up/up 172.30.10.23/26 sagemaker_cvo_sn1-01 e0a true svm_sagemaker_cvo_sn1_mgmt_lif up/up 172.30.10.32/26 sagemaker_cvo_sn1-01 e0a true svm_sagemaker_cvo_sn1_s3_lif up/up 172.30.10.41/26 sagemaker_cvo_sn1-01 e0a true 6 entries were displayed. sagemaker_cvo_sn1::*> sagemaker_cvo_sn1::*> vserver object-store-server create -vserver svm_sagemaker_cvo_sn1 -is-http-enabled true -object-store-server svm_sagemaker_cvo_s3_sn1 -is-https-enabled false sagemaker_cvo_sn1::*> vserver object-store-server show Vserver: svm_sagemaker_cvo_sn1 Object Store Server Name: svm_sagemaker_cvo_s3_sn1 Administrative State: up HTTP Enabled: true Listener Port For HTTP: 80 HTTPS Enabled: false Secure Listener Port For HTTPS: 443 Certificate for HTTPS Connections: - Default UNIX User: pcuser Default Windows User: - Comment: sagemaker_cvo_sn1::*>
-
Verifique os detalhes do agregado.
sagemaker_cvo_sn1::*> aggr show Aggregate Size Available Used% State #Vols Nodes RAID Status --------- -------- --------- ----- ------- ------ ---------------- ------------ aggr0_sagemaker_cvo_sn1_01 124.0GB 50.88GB 59% online 1 sagemaker_cvo_ raid0, sn1-01 normal aggr1 907.1GB 904.9GB 0% online 2 sagemaker_cvo_ raid0, sn1-01 normal 2 entries were displayed. sagemaker_cvo_sn1::*>
-
Crie um usuário e um grupo.
sagemaker_cvo_sn1::*> vserver object-store-server user create -vserver svm_sagemaker_cvo_sn1 -user s3user sagemaker_cvo_sn1::*> vserver object-store-server user show Vserver User ID Access Key Secret Key ----------- --------------- --------- ------------------- ------------------- svm_sagemaker_cvo_sn1 root 0 - - Comment: Root User svm_sagemaker_cvo_sn1 s3user 1 0ZNAX21JW5Q8AP80CQ2E PpLs4gA9K0_2gPhuykkp014gBjcC9Rbi3QDX_6rr 2 entries were displayed. sagemaker_cvo_sn1::*> sagemaker_cvo_sn1::*> vserver object-store-server group create -name s3group -users s3user -comment "" sagemaker_cvo_sn1::*> sagemaker_cvo_sn1::*> vserver object-store-server group delete -gid 1 -vserver svm_sagemaker_cvo_sn1 sagemaker_cvo_sn1::*> vserver object-store-server group create -name s3group -users s3user -comment "" -policies FullAccess sagemaker_cvo_sn1::*>
-
Criar um bucket no volume NFS.
sagemaker_cvo_sn1::*> vserver object-store-server bucket create -bucket ontapbucket1 -type nas -comment "" -vserver svm_sagemaker_cvo_sn1 -nas-path /vol1 sagemaker_cvo_sn1::*> vserver object-store-server bucket show Vserver Bucket Type Volume Size Encryption Role NAS Path ----------- --------------- -------- ----------------- ---------- ---------- ---------- ---------- svm_sagemaker_cvo_sn1 ontapbucket1 nas vol1 - false - /vol1 sagemaker_cvo_sn1::*>
AWS SageMaker
Para criar um AWS notebook a partir do AWS SageMaker, execute as seguintes etapas:
-
Certifique-se de que o usuário que está criando uma instância do notebook tenha uma política do IAM do AmazonSageMakerFullAccess ou faça parte de um grupo existente que tenha direitos do Amazon SageMakerFullAccess. Nesta validação, o utilizador faz parte de um grupo existente.
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Forneça as seguintes informações:
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Nome da instância do notebook.
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Tipo de instância.
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Identificador da plataforma.
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Selecione a função IAM que tem direitos AmazonSageMakerFullAccess.
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Acesso à raiz – Ativar.
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Chave de criptografia - Selecione nenhuma criptografia personalizada.
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Mantenha as restantes opções predefinidas.
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-
Nesta validação, os detalhes da instância do SageMaker são os seguintes:
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Inicie o AWS notebook.
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Abra o laboratório do Jupyter.
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Inicie sessão no terminal e monte o volume Cloud Volumes ONTAP.
sh-4.2$ sudo mkdir /vol1; sudo mount -t nfs 172.30.10.41:/vol1 /vol1 sh-4.2$ df -h Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on devtmpfs 2.0G 0 2.0G 0% /dev tmpfs 2.0G 0 2.0G 0% /dev/shm tmpfs 2.0G 624K 2.0G 1% /run tmpfs 2.0G 0 2.0G 0% /sys/fs/cgroup /dev/xvda1 140G 114G 27G 82% / /dev/xvdf 4.8G 72K 4.6G 1% /home/ec2-user/SageMaker tmpfs 393M 0 393M 0% /run/user/1001 tmpfs 393M 0 393M 0% /run/user/1002 tmpfs 393M 0 393M 0% /run/user/1000 172.30.10.41:/vol1 973M 189M 785M 20% /vol1 sh-4.2$
-
Verifique o bucket criado no volume do Cloud Volumes ONTAP usando os comandos da AWS CLI.
sh-4.2$ aws configure --profile netapp AWS Access Key ID [None]: 0ZNAX21JW5Q8AP80CQ2E AWS Secret Access Key [None]: PpLs4gA9K0_2gPhuykkp014gBjcC9Rbi3QDX_6rr Default region name [None]: us-east-1 Default output format [None]: sh-4.2$ sh-4.2$ aws s3 ls --profile netapp --endpoint-url 2023-02-10 17:59:48 ontapbucket1 sh-4.2$ aws s3 ls --profile netapp --endpoint-url s3://ontapbucket1/ 2023-02-10 18:46:44 4747 1 2023-02-10 18:48:32 96 setup.cfg sh-4.2$
Dados para aprendizado de máquina
Nesta validação, usamos um conjunto de dados do DBpedia, um esforço comunitário de origem coletiva, para extrair conteúdo estruturado das informações criadas em vários projetos da Wikimedia.
-
Baixe os dados da localização do DBpedia GitHub e extraia-os. Utilize o mesmo terminal utilizado na secção anterior.
sh-4.2$ wget --2023-02-14 23:12:11-- Resolving github.com (github.com)... 140.82.113.3 Connecting to github.com (github.com)|140.82.113.3|:443... connected. HTTP request sent, awaiting response... 302 Found Location: [following] --2023-02-14 23:12:11-- Resolving raw.githubusercontent.com (raw.githubusercontent.com)... 185.199.109.133, 185.199.110.133, 185.199.111.133, ... Connecting to raw.githubusercontent.com (raw.githubusercontent.com)|185.199.109.133|:443... connected. HTTP request sent, awaiting response... 200 OK Length: 68431223 (65M) [application/octet-stream] Saving to: ‘dbpedia_csv.tar.gz’ 100%[==============================================================================================================================================================>] 68,431,223 56.2MB/s in 1.2s 2023-02-14 23:12:13 (56.2 MB/s) - ‘dbpedia_csv.tar.gz’ saved [68431223/68431223] sh-4.2$ tar -zxvf dbpedia_csv.tar.gz dbpedia_csv/ dbpedia_csv/test.csv dbpedia_csv/classes.txt dbpedia_csv/train.csv dbpedia_csv/readme.txt sh-4.2$
-
Copie os dados para o local do Cloud Volumes ONTAP e verifique-os no bucket do S3 usando a CLI da AWS.
sh-4.2$ df -h Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on devtmpfs 2.0G 0 2.0G 0% /dev tmpfs 2.0G 0 2.0G 0% /dev/shm tmpfs 2.0G 628K 2.0G 1% /run tmpfs 2.0G 0 2.0G 0% /sys/fs/cgroup /dev/xvda1 140G 114G 27G 82% / /dev/xvdf 4.8G 52K 4.6G 1% /home/ec2-user/SageMaker tmpfs 393M 0 393M 0% /run/user/1002 tmpfs 393M 0 393M 0% /run/user/1001 tmpfs 393M 0 393M 0% /run/user/1000 172.30.10.41:/vol1 973M 384K 973M 1% /vol1 sh-4.2$ pwd /home/ec2-user sh-4.2$ cp -ra dbpedia_csv /vol1 sh-4.2$ aws s3 ls --profile netapp --endpoint-url s3://ontapbucket1/ PRE dbpedia_csv/ 2023-02-10 18:46:44 4747 1 2023-02-10 18:48:32 96 setup.cfg sh-4.2$
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Execute a validação básica para se certificar de que a funcionalidade de leitura/gravação funciona no bucket do S3.
sh-4.2$ aws s3 cp --profile netapp --endpoint-url /usr/share/doc/util-linux-2.30.2 s3://ontapbucket1/ --recursive upload: ../../../usr/share/doc/util-linux-2.30.2/deprecated.txt to s3://ontapbucket1/deprecated.txt upload: ../../../usr/share/doc/util-linux-2.30.2/getopt-parse.bash to s3://ontapbucket1/getopt-parse.bash upload: ../../../usr/share/doc/util-linux-2.30.2/README to s3://ontapbucket1/README upload: ../../../usr/share/doc/util-linux-2.30.2/getopt-parse.tcsh to s3://ontapbucket1/getopt-parse.tcsh upload: ../../../usr/share/doc/util-linux-2.30.2/AUTHORS to s3://ontapbucket1/AUTHORS upload: ../../../usr/share/doc/util-linux-2.30.2/NEWS to s3://ontapbucket1/NEWS sh-4.2$ aws s3 ls --profile netapp --endpoint-url s3://ontapbucket1/s3://ontapbucket1/ An error occurred (InternalError) when calling the ListObjectsV2 operation: We encountered an internal error. Please try again. sh-4.2$ aws s3 ls --profile netapp --endpoint-url s3://ontapbucket1/ PRE dbpedia_csv/ 2023-02-16 19:19:27 26774 AUTHORS 2023-02-16 19:19:27 72727 NEWS 2023-02-16 19:19:27 4493 README 2023-02-16 19:19:27 2825 deprecated.txt 2023-02-16 19:19:27 1590 getopt-parse.bash 2023-02-16 19:19:27 2245 getopt-parse.tcsh sh-4.2$ ls -ltr /vol1 total 132 drwxrwxr-x 2 ec2-user ec2-user 4096 Mar 29 2015 dbpedia_csv -rw-r--r-- 1 nobody nobody 2245 Apr 10 17:37 getopt-parse.tcsh -rw-r--r-- 1 nobody nobody 2825 Apr 10 17:37 deprecated.txt -rw-r--r-- 1 nobody nobody 4493 Apr 10 17:37 README -rw-r--r-- 1 nobody nobody 1590 Apr 10 17:37 getopt-parse.bash -rw-r--r-- 1 nobody nobody 26774 Apr 10 17:37 AUTHORS -rw-r--r-- 1 nobody nobody 72727 Apr 10 17:37 NEWS sh-4.2$ ls -ltr /vol1/dbpedia_csv/ total 192104 -rw------- 1 ec2-user ec2-user 174148970 Mar 28 2015 train.csv -rw------- 1 ec2-user ec2-user 21775285 Mar 28 2015 test.csv -rw------- 1 ec2-user ec2-user 146 Mar 28 2015 classes.txt -rw-rw-r-- 1 ec2-user ec2-user 1758 Mar 29 2015 readme.txt sh-4.2$ chmod -R 777 /vol1/dbpedia_csv sh-4.2$ ls -ltr /vol1/dbpedia_csv/ total 192104 -rwxrwxrwx 1 ec2-user ec2-user 174148970 Mar 28 2015 train.csv -rwxrwxrwx 1 ec2-user ec2-user 21775285 Mar 28 2015 test.csv -rwxrwxrwx 1 ec2-user ec2-user 146 Mar 28 2015 classes.txt -rwxrwxrwx 1 ec2-user ec2-user 1758 Mar 29 2015 readme.txt sh-4.2$ aws s3 cp --profile netapp --endpoint-url http://172.30.2.248/ s3://ontapbucket1/ /tmp --recursive download: s3://ontapbucket1/AUTHORS to ../../tmp/AUTHORS download: s3://ontapbucket1/README to ../../tmp/README download: s3://ontapbucket1/NEWS to ../../tmp/NEWS download: s3://ontapbucket1/dbpedia_csv/classes.txt to ../../tmp/dbpedia_csv/classes.txt download: s3://ontapbucket1/dbpedia_csv/readme.txt to ../../tmp/dbpedia_csv/readme.txt download: s3://ontapbucket1/deprecated.txt to ../../tmp/deprecated.txt download: s3://ontapbucket1/getopt-parse.bash to ../../tmp/getopt-parse.bash download: s3://ontapbucket1/getopt-parse.tcsh to ../../tmp/getopt-parse.tcsh download: s3://ontapbucket1/dbpedia_csv/test.csv to ../../tmp/dbpedia_csv/test.csv download: s3://ontapbucket1/dbpedia_csv/train.csv to ../../tmp/dbpedia_csv/train.csv sh-4.2$ sh-4.2$ aws s3 ls --profile netapp --endpoint-url s3://ontapbucket1/ PRE dbpedia_csv/ 2023-02-16 19:19:27 26774 AUTHORS 2023-02-16 19:19:27 72727 NEWS 2023-02-16 19:19:27 4493 README 2023-02-16 19:19:27 2825 deprecated.txt 2023-02-16 19:19:27 1590 getopt-parse.bash 2023-02-16 19:19:27 2245 getopt-parse.tcsh sh-4.2$
Valide o aprendizado de máquina dos notebooks Jupyter
A validação a seguir fornece os modelos de compilação, treinamento e implantação de machine learning por meio da classificação de texto usando o exemplo BlazingText SageMaker abaixo:
-
Instale os pacotes boto3 e SageMaker.
In [1]: pip install --upgrade boto3 sagemaker
Saída:
Looking in indexes: https://pypi.org/simple, https://pip.repos.neuron.amazo naws.com Requirement already satisfied: boto3 in /home/ec2-user/anaconda3/envs/pytho n3/lib/python3.10/site-packages (1.26.44) Collecting boto3 Downloading boto3-1.26.72-py3-none-any.whl (132 kB) ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 132.7/132.7 kB 14.6 MB/s eta 0: 00:00 Requirement already satisfied: sagemaker in /home/ec2-user/anaconda3/envs/p ython3/lib/python3.10/site-packages (2.127.0) Collecting sagemaker Downloading sagemaker-2.132.0.tar.gz (668 kB) ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 668.0/668.0 kB 12.3 MB/s eta 0: 00:0000:01 Preparing metadata (setup.py) ... done Collecting botocore<1.30.0,>=1.29.72 Downloading botocore-1.29.72-py3-none-any.whl (10.4 MB) ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 10.4/10.4 MB 44.3 MB/s eta 0: 00:0000:010:01 Requirement already satisfied: s3transfer<0.7.0,>=0.6.0 in /home/ec2-user/a naconda3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from boto3) (0.6.0) Requirement already satisfied: jmespath<2.0.0,>=0.7.1 in /home/ec2-user/ana conda3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from boto3) (0.10.0) Requirement already satisfied: attrs<23,>=20.3.0 in /home/ec2-user/anaconda 3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from sagemaker) (22.1.0) Requirement already satisfied: google-pasta in /home/ec2-user/anaconda3/env s/python3/lib/python3.10/site-packages (from sagemaker) (0.2.0) Requirement already satisfied: numpy<2.0,>=1.9.0 in /home/ec2-user/anaconda 3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from sagemaker) (1.22.4) Requirement already satisfied: protobuf<4.0,>=3.1 in /home/ec2-user/anacond a3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from sagemaker) (3.20.3) Requirement already satisfied: protobuf3-to-dict<1.0,>=0.1.5 in /home/ec2-u ser/anaconda3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from sagemaker) (0.1.5) Requirement already satisfied: smdebug_rulesconfig==1.0.1 in /home/ec2-use r/anaconda3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from sagemaker) (1. 0.1) Requirement already satisfied: importlib-metadata<5.0,>=1.4.0 in /home/ec2user/anaconda3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from sagemaker) (4.13.0) Requirement already satisfied: packaging>=20.0 in /home/ec2-user/anaconda3/ envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from sagemaker) (21.3) Requirement already satisfied: pandas in /home/ec2-user/anaconda3/envs/pyth on3/lib/python3.10/site-packages (from sagemaker) (1.5.1) Requirement already satisfied: pathos in /home/ec2-user/anaconda3/envs/pyth on3/lib/python3.10/site-packages (from sagemaker) (0.3.0) Requirement already satisfied: schema in /home/ec2-user/anaconda3/envs/pyth on3/lib/python3.10/site-packages (from sagemaker) (0.7.5) Requirement already satisfied: python-dateutil<3.0.0,>=2.1 in /home/ec2-use r/anaconda3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from botocore<1.30. 0,>=1.29.72->boto3) (2.8.2) Requirement already satisfied: urllib3<1.27,>=1.25.4 in /home/ec2-user/anac onda3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from botocore<1.30.0,>=1.2 9.72->boto3) (1.26.8) Requirement already satisfied: zipp>=0.5 in /home/ec2-user/anaconda3/envs/p ython3/lib/python3.10/site-packages (from importlib-metadata<5.0,>=1.4.0->s agemaker) (3.10.0) Requirement already satisfied: pyparsing!=3.0.5,>=2.0.2 in /home/ec2-user/a naconda3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from packaging>=20.0->s agemaker) (3.0.9) Requirement already satisfied: six in /home/ec2-user/anaconda3/envs/python 3/lib/python3.10/site-packages (from protobuf3-to-dict<1.0,>=0.1.5->sagemak er) (1.16.0) Requirement already satisfied: pytz>=2020.1 in /home/ec2-user/anaconda3/env s/python3/lib/python3.10/site-packages (from pandas->sagemaker) (2022.5) Requirement already satisfied: ppft>=1.7.6.6 in /home/ec2-user/anaconda3/en vs/python3/lib/python3.10/site-packages (from pathos->sagemaker) (1.7.6.6) Requirement already satisfied: multiprocess>=0.70.14 in /home/ec2-user/anac onda3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from pathos->sagemaker) (0.70.14) Requirement already satisfied: dill>=0.3.6 in /home/ec2-user/anaconda3/env s/python3/lib/python3.10/site-packages (from pathos->sagemaker) (0.3.6) Requirement already satisfied: pox>=0.3.2 in /home/ec2-user/anaconda3/envs/ python3/lib/python3.10/site-packages (from pathos->sagemaker) (0.3.2) Requirement already satisfied: contextlib2>=0.5.5 in /home/ec2-user/anacond a3/envs/python3/lib/python3.10/site-packages (from schema->sagemaker) (21. 6.0) Building wheels for collected packages: sagemaker Building wheel for sagemaker (setup.py) ... done Created wheel for sagemaker: filename=sagemaker-2.132.0-py2.py3-none-any. whl size=905449 sha256=f6100a5dc95627f2e2a49824e38f0481459a27805ee19b5a06ec 83db0252fd41 Stored in directory: /home/ec2-user/.cache/pip/wheels/60/41/b6/482e7ab096 520df034fbf2dddd244a1d7ba0681b27ef45aa61 Successfully built sagemaker Installing collected packages: botocore, boto3, sagemaker Attempting uninstall: botocore Found existing installation: botocore 1.24.19 Uninstalling botocore-1.24.19: Successfully uninstalled botocore-1.24.19 Attempting uninstall: boto3 Found existing installation: boto3 1.26.44 Uninstalling boto3-1.26.44: Successfully uninstalled boto3-1.26.44 Attempting uninstall: sagemaker Found existing installation: sagemaker 2.127.0 Uninstalling sagemaker-2.127.0: Successfully uninstalled sagemaker-2.127.0 ERROR: pip's dependency resolver does not currently take into account all t he packages that are installed. This behaviour is the source of the followi ng dependency conflicts. awscli 1.27.44 requires botocore==1.29.44, but you have botocore 1.29.72 wh ich is incompatible. aiobotocore 2.0.1 requires botocore<1.22.9,>=1.22.8, but you have botocore 1.29.72 which is incompatible. Successfully installed boto3-1.26.72 botocore-1.29.72 sagemaker-2.132.0 Note: you may need to restart the kernel to use updated packages.
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Na etapa a seguir, os dados (
dbpedia_csv
) são baixados do bucket do S3ontapbucket1
para uma instância do Jupyter notebook usada no aprendizado de máquina.In [2]: import sagemaker In [3]: from sagemaker import get_execution_role In [4]: import json import boto3 sess = sagemaker.Session() role = get_execution_role() print(role) bucket = "ontapbucket1" print(bucket) sess.s3_client = boto3.client('s3',region_name='',aws_access_key_id = '0ZNAX21JW5Q8AP80CQ2E', aws_secret_access_key = 'PpLs4gA9K0_2gPhuykkp014gBjcC9Rbi3QDX_6rr', use_ssl = False, endpoint_url = 'http://172.30.10.41', config=boto3.session.Config(signature_version='s3v4', s3={'addressing_style':'path'}) ) sess.s3_resource = boto3.resource('s3',region_name='',aws_access_key_id = '0ZNAX21JW5Q8AP80CQ2E', aws_secret_access_key = 'PpLs4gA9K0_2gPhuykkp014gBjcC9Rbi3QDX_6rr', use_ssl = False, endpoint_url = 'http://172.30.10.41', config=boto3.session.Config(signature_version='s3v4', s3={'addressing_style':'path'}) ) prefix = "blazingtext/supervised" import os my_bucket = sess.s3_resource.Bucket(bucket) my_bucket = sess.s3_resource.Bucket(bucket) #os.mkdir('dbpedia_csv') for s3_object in my_bucket.objects.all(): filename = s3_object.key # print(filename) # print(s3_object.key) my_bucket.download_file(s3_object.key, filename)
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O código a seguir cria o mapeamento de índices inteiros para rótulos de classe que são usados para recuperar o nome da classe real durante a inferência.
index_to_label = {} with open("dbpedia_csv/classes.txt") as f: for i,label in enumerate(f.readlines()): index_to_label[str(i + 1)] = label.strip()
A saída lista os arquivos e pastas no
ontapbucket1
bucket que são usados como dados para a validação de aprendizado de máquina do AWS SageMaker.arn:aws:iam::210811600188:role/SageMakerFullRole ontapbucket1 AUTHORS AUTHORS NEWS NEWS README README dbpedia_csv/classes.txt dbpedia_csv/classes.txt dbpedia_csv/readme.txt dbpedia_csv/readme.txt dbpedia_csv/test.csv dbpedia_csv/test.csv dbpedia_csv/train.csv dbpedia_csv/train.csv deprecated.txt deprecated.txt getopt-parse.bash getopt-parse.bash getopt-parse.tcsh getopt-parse.tcsh In [5]: ls AUTHORS deprecated.txt getopt-parse.tcsh NEWS Untitled.ipynb dbpedia_csv/ getopt-parse.bash lost+found/ README In [6]: ls -l dbpedia_csv total 191344 -rw-rw-r-- 1 ec2-user ec2-user 146 Feb 16 19:43 classes.txt -rw-rw-r-- 1 ec2-user ec2-user 1758 Feb 16 19:43 readme.txt -rw-rw-r-- 1 ec2-user ec2-user 21775285 Feb 16 19:43 test.csv -rw-rw-r-- 1 ec2-user ec2-user 174148970 Feb 16 19:43 train.csv
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Inicie a fase de pré-processamento de dados para pré-processar os dados de treinamento em um formato de texto tokenizado separado por espaço que pode ser consumido pelo algoritmo BlazingText e pela biblioteca nltk para tokenizar as frases de entrada do conjunto de dados DBPedia. Baixe o tokenizer nltk e outras bibliotecas. O
transform_instance
aplicado a cada instância de dados em paralelo usa o módulo de multiprocessamento Python.ln [7]: from random import shuffle import multiprocessing from multiprocessing import Pool import csv import nltk nltk.download("punkt") def transform_instance(row): cur_row = [] label ="__label__" + index_to_label [row[0]] # Prefix the index-ed label with __label__ cur_row.append (label) cur_row.extend(nltk.word_tokenize(row[1].lower ())) cur_row.extend(nltk.word_tokenize(row[2].lower ())) return cur_row def preprocess(input_file, output_file, keep=1): all_rows = [] with open(input_file,"r") as csvinfile: csv_reader = csv.reader(csvinfile, delimiter=",") for row in csv_reader: all_rows.append(row) shuffle(all_rows) all_rows = all_rows[: int(keep * len(all_rows))] pool = Pool(processes=multiprocessing.cpu_count()) transformed_rows = pool.map(transform_instance, all_rows) pool.close() pool. join() with open(output_file, "w") as csvoutfile: csv_writer = csv.writer (csvoutfile, delimiter=" ", lineterminator="\n") csv_writer.writerows (transformed_rows) # Preparing the training dataset # since preprocessing the whole dataset might take a couple of minutes, # we keep 20% of the training dataset for this demo. # Set keep to 1 if you want to use the complete dataset preprocess("dbpedia_csv/train.csv","dbpedia.train", keep=0.2) # Preparing the validation dataset preprocess("dbpedia_csv/test.csv","dbpedia.validation") sess = sagemaker.Session() role = get_execution_role() print (role) # This is the role that sageMaker would use to leverage Aws resources (S3, Cloudwatch) on your behalf bucket = sess.default_bucket() # Replace with your own bucket name if needed print("default Bucket::: ") print(bucket)
Saída:
[nltk_data] Downloading package punkt to /home/ec2-user/nltk_data... [nltk_data] Package punkt is already up-to-date! arn:aws:iam::210811600188:role/SageMakerFullRole default Bucket::: sagemaker-us-east-1-210811600188
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Carregue o conjunto de dados formatado e de treinamento para S3 para que ele possa ser usado pelo SageMaker para executar trabalhos de treinamento. Em seguida, faça upload de dois arquivos para a localização do bucket e do prefixo usando o SDK Python.
ln [8]: %%time train_channel = prefix + "/train" validation_channel = prefix + "/validation" sess.upload_data(path="dbpedia.train", bucket=bucket, key_prefix=train_channel) sess.upload_data(path="dbpedia.validation", bucket=bucket, key_prefix=validation_channel) s3_train_data = "s3://{}/{}".format(bucket, train_channel) s3_validation_data = "s3://{}/{}".format(bucket, validation_channel)
Saída:
CPU times: user 546 ms, sys: 163 ms, total: 709 ms Wall time: 1.32 s
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Configure um local de saída em S3 onde o artefato do modelo é carregado para que os artefatos possam ser a saída do trabalho de treinamento do algoritmo. Crie
sageMaker.estimator.Estimator
um objeto para iniciar o trabalho de formação.In [9]: s3_output_location = "s3://{}/{}/output".format(bucket, prefix) In [10]: region_name = boto3.Session().region_name In [11]: container = sagemaker.amazon.amazon_estimator.get_image_uri(region_name, "blazingtext","latest") print("Using SageMaker BlazingText container: {} ({})".format(container, region_name))
Saída:
The method get_image_uri has been renamed in sagemaker>=2. See: https://sagemaker.readthedocs.io/en/stable/v2.html for details. Defaulting to the only supported framework/algorithm version: 1. Ignoring f ramework/algorithm version: latest. Using SageMaker BlazingText container: 811284229777.dkr.ecr.us-east-1.amazo naws.com/blazingtext:1 (us-east-1)
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Defina o SageMaker com
Estrimator
configurações de recursos e hiperparâmetros para treinar a classificação de texto no conjunto de dados DBPedia usando o modo supervisionado em uma instância do c4,4xlarge.In [12]: bt_model = sagemaker.estimator.Estimator( container, role, instance_count=1, instance_type="ml.c4.4xlarge", volume_size=30, max_run=360000, input_mode="File", output_path=s3_output_location, hyperparameters={ "mode": "supervised", "epochs": 1, "min_count": 2, "learning_rate": 0.05, "vector_dim": 10, "early_stopping": True, "patience": 4, "min_epochs": 5, "word_ngrams": 2, }, )
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Prepare um handshake entre os canais de dados e o algoritmo. Para fazer isso, crie os
sagemaker.session.s3_input
objetos dos canais de dados e mantenha-os em um dicionário para que o algoritmo consuma.ln [13]: train_data = sagemaker.inputs.TrainingInput( s3_train_data, distribution="FullyReplicated", content_type="text/plain", s3_data_type="S3Prefix", ) validation_data = sagemaker.inputs.TrainingInput( s3_validation_data, distribution="FullyReplicated", content_type="text/plain", s3_data_type="S3Prefix", ) data_channels = {"train": train_data, "validation": validation_data}
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Depois que o trabalho terminar, é apresentada uma mensagem trabalho concluído. O modelo treinado pode ser encontrado no balde S3 que foi configurado como o
output_path
no estimador.ln [14]: bt_model.fit(inputs=data_channels, logs=True)
Saída:
INFO:sagemaker:Creating training-job with name: blazingtext-2023-02-16-20-3 7-30-748 2023-02-16 20:37:30 Starting - Starting the training job...... 2023-02-16 20:38:09 Starting - Preparing the instances for training...... 2023-02-16 20:39:24 Downloading - Downloading input data 2023-02-16 20:39:24 Training - Training image download completed. Training in progress... Arguments: train [02/16/2023 20:39:41 WARNING 140279908747072] Loggers have already been set up. [02/16/2023 20:39:41 WARNING 140279908747072] Loggers have already been set up. [02/16/2023 20:39:41 INFO 140279908747072] nvidia-smi took: 0.0251793861389 16016 secs to identify 0 gpus [02/16/2023 20:39:41 INFO 140279908747072] Running single machine CPU Blazi ngText training using supervised mode. Number of CPU sockets found in instance is 1 [02/16/2023 20:39:41 INFO 140279908747072] Processing /opt/ml/input/data/tr ain/dbpedia.train . File size: 35.0693244934082 MB [02/16/2023 20:39:41 INFO 140279908747072] Processing /opt/ml/input/data/va lidation/dbpedia.validation . File size: 21.887572288513184 MB Read 6M words Number of words: 149301 Loading validation data from /opt/ml/input/data/validation/dbpedia.validati on Loaded validation data. -------------- End of epoch: 1 ##### Alpha: 0.0000 Progress: 100.00% Million Words/sec: 10.39 ##### Training finished. Average throughput in Million words/sec: 10.39 Total training time in seconds: 0.60 #train_accuracy: 0.7223 Number of train examples: 112000 #validation_accuracy: 0.7205 Number of validation examples: 70000 2023-02-16 20:39:55 Uploading - Uploading generated training model 2023-02-16 20:40:11 Completed - Training job completed Training seconds: 68 Billable seconds: 68
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Após a conclusão do treinamento, implante o modelo treinado como um endpoint hospedado em tempo real do Amazon SageMaker para fazer previsões.
In [15]: from sagemaker.serializers import JSONSerializer text_classifier = bt_model.deploy( initial_instance_count=1, instance_type="ml.m4.xlarge", serializer=JSONS )
Saída:
INFO:sagemaker:Creating model with name: blazingtext-2023-02-16-20-41-33-10 0 INFO:sagemaker:Creating endpoint-config with name blazingtext-2023-02-16-20 -41-33-100 INFO:sagemaker:Creating endpoint with name blazingtext-2023-02-16-20-41-33- 100 -------!
In [16]: sentences = [ "Convair was an american aircraft manufacturing company which later expanded into rockets and spacecraft.", "Berwick secondary college is situated in the outer melbourne metropolitan suburb of berwick .", ] # using the same nltk tokenizer that we used during data preparation for training tokenized_sentences = [" ".join(nltk.word_tokenize(sent)) for sent in sentences] payload = {"instances": tokenized_sentences} response = text_classifier.predict(payload) predictions = json.loads(response) print(json.dumps(predictions, indent=2))
[ { "label": [ "__label__Artist" ], "prob": [ 0.4090951681137085 ] }, { "label": [ "__label__EducationalInstitution" ], "prob": [ 0.49466073513031006 ] } ]
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Por padrão, o modelo retorna uma previsão com a maior probabilidade. Para recuperar as previsões superiores
k
, definak
no arquivo de configuração.In [17]: payload = {"instances": tokenized_sentences, "configuration": {"k": 2}} response = text_classifier.predict(payload) predictions = json.loads(response) print(json.dumps(predictions, indent=2))
[ { "label": [ "__label__Artist", "__label__MeanOfTransportation" ], "prob": [ 0.4090951681137085, 0.26930734515190125 ] }, { "label": [ "__label__EducationalInstitution", "__label__Building" ], "prob": [ 0.49466073513031006, 0.15817692875862122 ] } ]
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Exclua o endpoint antes de fechar o notebook.
In [18]: sess.delete_endpoint(text_classifier.endpoint) WARNING:sagemaker.deprecations:The endpoint attribute has been renamed in s agemaker>=2. See: https://sagemaker.readthedocs.io/en/stable/v2.html for details. INFO:sagemaker:Deleting endpoint with name: blazingtext-2023-02-16-20-41-33 -100